ALIRAN PENDIDIKAN

1. Tingkatan 1 - Penilaian Intensif Bahasa ( Arab /
Inggeris)
2. Tingkatan 2 - Sijil Menengah Rendah Agama ( SMRA )
3. Tingkatan 3 - Penilaian Menengah Rendah ( PMR )
4. Tingkatan 4 - Sijil Menengah Agama ( SMA )

5. Tingkatan 5 - Sijil Pelajaran Malaysia ( SPM )
- Pra Sijil Tinggi Agama Malaysia ( pra STAM )
6. Tingkatan 6 - Sijil Tinggi Agama Malaysia ( STAM )*
( ambil peperiksaan di Maahad Johor, Johor Bahru)

PEPERIKSAAN

Peperiksaan Intensif Bahasa, SMRA dan SMA dikenali oleh Lembaga Peperiksaan, Bahagian Pendidikan, Jabatan Agama Islam Negeri Johor. Manakala, PMR, SPM, dan STAM di bawah Lembaga Peperiksaan Malaysia, Kementerian Pendidikan Malaysia.
Kelulusan ini melayakan pelajar keluaran Maahad Pontian menyambung pengajian ke Universiti – Universiti tempatan samada IPTA ataupun IPTS, juga layak menyambung pelajaran ke Universiti Luar Negara seperti Universiti Al-Azhar ( Mesir ), Universiti – Universiti Jordan dan juga lain – lain universiti timur tengah.